阴阳在人体组织结构上的划分。人体是一个有机的整体，它的一切组织结构，既是有机联系的，又是相互对立的。它们对立而又统一的关系都可以用阴阳的属性来加以划分的。就人体部位来讲，上部属阳，下部属阴；体表属阳，体内属阴，背部属阳，腹部属阴；外侧属阳，内侧属阴。就脏腑来讲，六腑为阳，五脏为阴，五脏之中又分阴阳，即心肺从部位上米划分属阳，肝脾肾属阴。具体到每一个脏腑又可以再分阴阳，知心有心阳、心阴；胄有胃阳，胃阴等。就物质与功能而言，功能活动为阳，物质基础为阴。但功能中又可分阴阳，物质中也可分阴阳。如气为阳，血为阴。总之，人体上下，内外各组织结构之间以及每一组织结构本身，虽然关系复杂，但都可以用阴阳来概括说明。故古人说“人生有形，不离阴阳”。
阴阳在人体生理功能上的体现。人体的生理功能有多种多样，如各脏腑组织都有它各自的生理功能；气、血、津液也都有各自的生理功能。但人体的生理功能也可用阴阳米概括；如上升的、外出的，必奋的届阳；下降的、内收的、抑制的属阴。同时，这两类生理功能之间，又是相互依存、相互制约和相互转化的。所以《索问·阴阳应象大论》说：“阴在内，阳之守也；阳在外，阴之使也”。