单纯肥胖症对儿童心血管，呼吸功能产生长期慢性的损伤，迟滞儿童的有氧能力发育，提前动用心肺储备功能，降低体质健康水平，阻碍心理行为发展，压抑潜能发育。儿童期单纯肥胖症还是成人期心血管疾病、糖尿病、高血压和某些部位癌症的重要危险因素。
儿童单纯肥胖症还造成儿童难以克服的心理行为损伤，使儿童的自尊心、自信心受到严重损伤，对儿童的性格塑造，气质培养，习惯养成有破坏性的负面影响。并且40%的儿童青少年肥胖者将在成年后继续肥胖，由于社会习俗和认同方面存在的偏见，肥胖者在升学、求职、社交、婚姻方面都面临着更多的压力。