从发生部位分：骨关节结核、滑模结核和全关节结核三种。
骨关节结核分骨关节结核、滑模结核和全关节结核三种，这对诊断、治疗方案的选定和预后的判断有指导意义。
1、骨关节结核
其发病部位不同，临床表现也不同，可以分为以下几种骨关节结核。
松质骨关节结核：按病灶的部位可以分为中心型和边缘型两种。中心型因为血供不好容易形成死骨，死骨吸收后形成空洞。边缘型的主要表现骨缺损。
皮质骨关节结核：病变多从髓腔开始，呈局限性溶骨性破坏，一般不形成大块死骨，儿童可以呈葱皮样增殖，成人和老年人没有这种改变。
干骺端骨关节结核：兼有松质骨和皮质骨的特点。
2、滑膜结核
滑模起于中胚层，广泛分布于关节、剑鞘和滑囊的内层，受结核菌感染后形成滑膜结核。滑模结核的发展规律：滑膜炎、血管翳形成、软骨和骨骼破坏，如果吸收好转则治愈，如果形成寒性脓肿最后穿破关节腔，发展成为全关节结核。
3、全关节结核
骨端的骨关节结核其肉芽、脓液穿破软骨面形成全关节结核。有人认为网状内皮组织随着滑膜延伸至关节软骨下，由于解剖上关系滑膜结核可经软骨边缘侵入软骨面下方，随着病变的发展，软骨面坏死脱落进入关节腔，也将演变成全关节结核，如果软骨面大部分被破坏，治愈后发生纤维性或骨性强直，关节功能将大部分丧失。总之，单纯骨关节结核或滑膜结核未能及时有效的治疗均可发展形成全关节结核。