病原诊断
从粪便内检查虫卵或孵化毛蚴以及直肠粘膜活体组织检查虫卵。
1、直接涂片法：重感染地区病人粪便或急性血吸虫病人的粘液血便中常可检查到血吸虫虫卵，方法简便，但虫卵检出率低。
2、毛蚴孵化法：可以提高阳性检出率。
3、定量透明法：用作血吸虫虫卵计数。
4、直肠粘膜活体组织检查：慢性及晚期血吸虫病人肠壁组织增厚，虫卵排出受阻，故粪便中不易查获虫卵，可应用直肠镜检查。
免疫诊断
一、皮内试验
一般皮内试验与粪检虫卵阳性的符合率为90%左右，但可出现假阳性或假阴性反应，与其他吸虫病可产生较高的交叉反应；并且病人治愈后多年仍可为阳性反应。此法简便、快速、通常用于现场筛选可疑病例。
二、检测抗体
血吸病人血清中存在特异性抗体，包括IgM、IgG、IgE等，如受检者未经病原治疗，而特异性抗体呈阳性反应，对于确定诊断意义较大；如已经病原治疗，特异性抗体阳性，并不能确定受检者体内仍有成虫寄生，因治愈后，特异性抗体在体内仍可维持较长时间。目前检测抗体的血吸虫病血清学诊断方法很多，常用的有以下几种。
1、环卵沉淀试验
通常检查100个虫卵，阳性反应虫卵数（环沉率）等于或大于5%时，即为阳性。粪检血吸虫卵阳性者，COPT阳性率平均为97.3%（94.1%～100%）。
2、间接红细胞凝集试验
粪检血吸虫虫卵阳性者与IHA阳性符合率为92.3%～100%，正常人假阳性率在2%左右，与肺吸虫、华支睾吸虫、旋毛虫感染者可出现假阳性反应。IHA操作简便，用血量少，判读结果快，目前国内已广泛应用。
3、酶联免疫吸附试验
此试验具有较高的敏感性和特异性，并且可反应抗体水平，阳性检出率在95%～100%，假阳性率为2.6%，病人在吡喹酮治疗后半年至一年有50%至70%转为阴性。
4、免疫酶染色试验
值得提出，近年来随着科技的发展，某些高科技和新方法被逐步引用到血吸虫病的诊断和研究领域。例如免疫印渍技术(immunoblotting）又称（westernblot），是在蛋白质凝胶电泳和固相免疫测定的基础上建立的一种具有分子水平的免疫学新技术，有力推动了血吸虫病血清学诊断方法的进展，它不但能对血吸虫抗原的限定组分蛋白进行分析和鉴定，而且能用以诊断病人和区分血吸虫病不同病期的新型血清学诊断方法。又如杂交瘤技术制备单克隆抗体（McAb）的应用。采用特异的McAb纯化血吸虫抗原，用于血吸虫病血清学诊断；也可应用McAb检测循环抗原，为血吸虫病诊断提供新的途径。
三、检测循环抗原
由于治疗后抗体在宿主体内存留较长时间，其阳性结果往往不能区分现症感染和既往感染，也不易于评价疗效。循环抗原是生活虫体排放至宿体内的大分子微粒，主要是虫体排泄、分泌或表皮脱落物中具有抗原特性，又可为血清免疫学试验所检出。从理论上讲，CAg的检测有其自身的优越性，它不仅能反映活动性感染，而且可以评价疗效和估计虫种。