急性期如有发热，应卧床休息或住院治疗，并补充营养和支持治疗。病情严重者可用肾上腺皮质激素治疗。慢性期以病原治疗为主，有贫血及营养不良者，予以支持治疗。晚期患者应适当休息，给予低盐、高蛋白饮食，增加营养，改善全身状况。对血浆蛋白明显减低伴高度腹水者，可输血浆或人血白蛋白，并适当利尿。巨脾型采用脾切除加大网膜腹膜后固定术。异位性损害如脑血吸虫病有癫痫症状者，给苯巴比妥、安定、苯妥英钠等控制发作。
以吡喹酮为首选药物。吡喹酮为一广谱抗蠕虫药，治疗血吸虫病疗效卓著。急性血吸虫病患者，吡喹酮治疗后，6～12个月粪便检查阴转率为90%左右，慢性与晚期患者为91%～100%。
①急性血吸虫病：总剂量按120mg/kg计算，分12次、4天服完，体重超过60kg者，仍按60kg计算，应以住院治疗为宜。
②慢性血吸虫病：一般可采用总剂量60mg/kg，分6次、2天服完，或40mg/kg顿服。个别年老体弱者，总剂量可减至35～40mg/kg，两次分服。
③慢性血吸虫病：晚期患者多数患夹杂症，药代动力学研究表明慢性与晚期患者服用吡喹酮后，药物吸收慢、排泄差，血药浓度明显增高，并维持较长时间，晚期患者血液浓度更高。因此，药物剂量应适当减少和个体化。一般可按总剂量40mg/kg计，一次服完，或分两次1天服完。服药期间应加强观察，服药前后应暂时停用利尿剂。