阴阳睡梦论是在“形神合一”整体观思想指导下，用阴阳学说阐述睡眠和梦幻机理的理论。睡眠及与之相伴随而发生的梦，是人生活中重要的心理生理现象，它们是机体脏腑气血阴阳虚实变化的一种表现，寤寐的交替过程，就是卫阳之气由阳入阴及由阴出阳的过程。
卫气之阴阳出入，与昼夜之阴阳变化、体质之阴阳盛衰等密切相关。正因寤寐之理本于阴阳，所以生活起居法于阴阳，才有利于身心健康；寤寐失常调于阴阳，才堪称为治疗大法。睡中梦境，乃由脏腑阴阳盛衰所致，故有“十二盛”及“十五不足”之梦幻。据此，可作为疾病脏腑阴阳虚实辨证的参考。尤其是某些疾病在未明显形于外之前，常常先有奇异怪梦先兆，这时，应用阴阳五行、脏象理论认真分析，往往可早期发现，以便早期治疗。