女性生殖器疱疹症状是会伴有低热、寒颤、腹痛、恶心，腹股沟淋巴节肿大，并且会并发宫颈炎与子宫炎。后期病毒播散性感染累及尿道、膀胱粘膜时，会出现排尿困难尿频、尿痛、严重者会发生尿潴留等症状，此外，女性生殖器疱疹症状还可能有其它症状同时出现，如发热、全身不适、头痛、颈项强直、膜炎和骶部神经系统功能不全。
生殖器疱疹要是累及口唇时，会引起唇部单纯疱疹。要是孕妇感染疱疹病毒，会由胎盘传染给胎儿，导致后代发生小头畸型，先天性心脏病，肢体缺损，小眼畸型等疾病。要是分娩期感染给新生儿，胎儿多并发脑炎，因此性传播疾病给妇女带来的危害，是要比给男子带来的危害严重得多。