锁肛痔的最早症状是便血，血中常夹粘液，血色鲜红，呈间歇性，常被误认为内痔。随病情发展，可出现大便次数增多，里急后重，肛门坠胀，粪便中央有粘液脓血，呈暗红色，有特殊臭味。病至后期，由于肿块侵犯，肠腔狭窄，使大便变细、变扁，及腹胀、腹痛、食欲不振、疲乏无力等。
直肠指检在肛管直肠癌的早期诊断上有重要意义。80%直肠癌位于手指可触及的部位。手指触及肠壁上有大小不等的无痛性硬结或溃疡，推之不移，或肠腔狭窄，指套染有脓血粘液。肛管癌较少见，早期肿块较小，呈疣状，生长迅速，表面凹凸不平，或变为溃疡，质地坚硬，渗流臭水。
肛门镜或直肠镜检可见肠壁肿块或溃疡的范围，并可取小块组织作病理切片检查，以明确诊断。若指检和直肠镜检均未发现直肠病变，但临床症状明显者，应作乙状结肠镜或纤维结肠镜检查。
早期大便出血，便次增多，应与痢疾、肠炎、内痔出血等鉴别。指检触到肿块应与息肉、肛乳头肥大相鉴别。这些疾病的鉴别可借助大便常规、大便培养、肛镜和直肠镜检查以及活组织病理切片检查等进行诊断。