陈旧性肛裂主要靠手术治疗，保守疗法难以根治。常见的手术疗法包括扩肛法、切除疗法、肛裂侧切术和纵切横缝法。
扩肛法，适应证早期肛裂，陈旧性肛裂且无结缔组织外痔、肛乳头肥大者。操作方法取截石位或侧卧位，在腰俞穴麻醉或局部麻醉下，术者戴橡皮手套，并将双手食指和中指涂上润滑剂，先将右手食指插人肛门，再插入左手食指，两手腕部交叉，两手食指掌侧向外侧逐渐加力扩张肛管，以后逐渐伸人食指和中指，扩肛持续3-5分钟，使肛管内外括约肌持续松弛。手术中注意勿用暴力快速扩张肛管，以免撕裂粘膜和皮肤，术后肛管外涂消痔膏或黄连素软膏。每隔2-3天扩肛一次。
切除疗法，适应证陈旧性肛裂伴有结缔组织外痔或肛乳头肥大者。操作方法取截石位或侧卧位，局部消毒麻醉，以肛裂裂口为中心作一梭形切口，切除肛裂创面疤痕组织及栉膜带、哨兵痔、肥大的肛乳头。再切断外括约肌皮下部及部分内括约肌。切口向外适当延长，使切口成一底小口大的。V。字形创口，并用红油膏纱条嵌压创面，再用纱布覆盖固定，术后每天换药直至痊愈。
肛裂侧切术，适应证不伴哨兵痔、皮下痿、肛乳头肥大等且病情较轻的陈旧性肛裂。操作方法取截石位或侧卧位，局部消毒麻醉，在肛门一侧（3点或9点）距肛缘1.5em处作一纵形切口，深达皮下，用弯止血钳，从切口插入（另一手食指伸人肛内），向肛门方向挑出部分内括约肌及外括约肌皮下部并剪断，再稍用力扩张肛门（使括约肌回缩），切口一般不缝合，外涂黄连素软膏后盖敷料。术后每天坐浴、换药，直至痊愈。
纵切横缝法，适应证陈旧性肛裂伴有肛管狭窄者。操作方法在腰俞穴麻醉下，取截石位或侧卧位，局部消毒后，沿肛裂正中作一纵切口，上至齿线上0.5cm，下至肛缘外0.5cm，切断栉膜带及部分内括约肌纤维，一并切除肥大的肛乳头、哨兵痔、肛窦，修剪创缘，游离切口下端的皮肤，以减少张力，彻底止血，然后用细丝线从切口上端进针，稍带基底组织，再从切口下端皮肤穿出结扎，使纵切口变成横缝合，一般缝合3-4针，外盖凡士林或黄连素纱条后再盖敷料。术后处理进流质饮食3-5天，控制大便1-2天。大便后用1／5000高锰酸钾溶液坐浴再涂黄连素软膏。