由于新生儿免疫机能低下，分娩时经过产道感染或生后喂养因奶瓶、奶嘴消毒不严，或用不洁之物揩洗口腔而感染鹅口疮，也可经不洁之母亲奶头而感染鹅口疮。过长时间服用抗生素，致使新生儿肠道内菌群紊乱，也是鹅口疮的发病原因之一。
新生儿鹅口疮轻者仅在口腔两颊粘膜上可见白色点状或片状物，很像奶凝块的模样，如果发展下去将遍及全口腔粘膜，宝宝虽然饥饿，哭闹觅食，但奶到嘴里却因疼痛摇头拒食、不肯吸吮。严重时可引起的口腔霉菌感染，并蔓延到下消化道，引起霉菌性肠炎。
预防治疗鹅口疮，首先对产妇的阴道霉菌病应积极治疗，新生儿出生后对所用食具应严格进行煮沸消毒。当发现宝宝口腔内有类似奶瓣的斑块时，不要随便揩洗，以免粘膜损伤引起感染。治疗鹅口疮最简便的方法是用市售紫药水涂患处，每日1至2次，如果仍不见好转，再用制霉菌素涂抹，一般几天就可治愈。万万不可用布去擦，以免继发细菌感染。