由于蛲虫病患者是本病的传染源，蛲虫病又极易自身感染、接触感染、吸入感染等。这样蛲虫病易广泛流行，以及在分布上具有儿童集体机械聚集性和家庭聚集性的特点，因此在治疗上应同时集体服药治疗，以达到根治的目的。
一、口服药物
甲苯咪唑（安乐士）是近年来临床广泛应用的广谱驱虫药之一，口服后5%～10%的剂量以肠道收，绝大部分从粪便中排出，单剂1片（100mg），在2周或4周后分别重服1次。孕妇尽量避免使用。速效肠虫净（复方甲苯咪唑）除含有甲苯咪唑100mg外，还含有左旋咪唑25mg。成人2片顿服，1周后虫卵阴转率达98.5%。
肠虫清片，主要成分阿苯达唑，通过抑制寄生虫肠壁细胞的浆微管系统的聚合，阻断虫体对多种营养及葡萄糖的吸收，导致寄生虫能量之耗竭，致虫体死亡。该药除杀死成虫及幼虫外，并使虫卵不能孵化，服药方法：两岁以上儿童及成人顿服2片（400mg）；1～2岁者服1片；1岁以下者及孕妇不宜服用。
中药：使君子，去外皮，炒熟。服后不能饮水，以免发生呃逆。若与百部等量服用则效果更佳。
二、局部用药
①用2%白陈汞软膏，或10%氧化锌油膏涂抹肛门，既可止痒，又可减少自身重复感染。
②用0.2%龙胆紫和3%百部药膏挤入肛门内少许，连续应用数天。
③六神丸塞肛治疗：中药六神丸，7岁以下者5粒，8岁以上者10粒，每日1次，共5天，治愈可达97.10%。
④灌肠法：食醋加水3倍，每晚直肠灌注50～60ml，连续3～5天。
中药灌肠：生百部，乌梅，加水，煎至，用50～100ml保留灌肠，每晚1次，5～10次为一疗程。