深圳市中医院于1975年成立，座落于深圳市福田区中心区，占地面积37975平方米，医疗用房面积8.5万平方米，设住院部和两个门诊部。下属机构有深圳市中医药研究所、深圳市国际中医药人才培训中心、深圳市传统医疗中心。目前医院年门诊量超过145万人次，年收治病人万余人次，是深圳市重要的大型综合性专科医院。现有职工千余人，卫生技术人员中，有正高级职称近百人，副高级职称200余人；有博士近35人，硕士近75人；有享受国务院特殊津贴专家3人，市政府特殊津贴专家3人，国家高级师带徒专家３人，广东省名中医5人，深圳市名中医14人，优秀中医10名。目前医院固定资产超过6亿元，其中医疗设备值超过2亿元，大型设备有MRI、螺旋CT机、数字化胃肠X光机、MS人工肝支持系统等。现有国家级中医重点专科1个（肝病专科）；省级中医重点专科4个（肝病专科、中医急诊、针灸科、肾病专及中医重点专科）
科建设单位2个（骨伤科、脾胃专科）；市级重点医学专科4个。有国家二级实验室一所分子生物学实验室。在研课题100余项。
先后中标国家自然科学基金科研课题6项、广东省自然科学基金科研课题4项，国家中医药管理局科研课题7项。作为广州中医药大学附属医院，有5位博士导师、35位硕士生导师，有20多个临床教研室，已形成博士、硕士、本科、专科、自考等多层次的教学体系；医院先后与美国Thomas Jefferson大学、德国MEDICAL PARK康复医院建立临床协作关系，与香港中文大学中医学院、香港浸会大学中医学院、香港中医学会会立中医学院、香港国际针灸学院等建立了固定的教学协作及学术交流关系；有20多个专业学术团体挂靠医院成立。医院先后被授予“广东省百家文明医院”“广东省文明中医院”“广东建设中医药强省项目中医名院”“深圳市卫生系统先进集体”“深圳市卫生系统行风建设先进单位”。