他成立了全国第一家中医耳鼻咽喉科。建立了“干氏中医耳鼻喉科理论体系”，被全国同行认同。制定两个被全国规范化教材选用的新病种：多涕症和喉源性咳嗽。出版《中医耳鼻喉科学》，主编多部中医耳鼻喉科教材。
干祖望，男，1912年9月生，上海松江人，农工民主党党员，教授，南京中医药大学附属医院主任中医师。
1929年至1933年师从浙江名医钟道生，1953年至1954年在中央机关直属第二医院耳鼻喉科进修。中华中医药学会耳鼻喉科专业委员会主任委员、名誉主任委员，第一批全国老中医药专家学术经验继承指导教师，享受国务院政府特殊津贴专家。2005年科技部“名老中医学术思想及临证经验传承研究”100名中医学家之一。1985年被江苏省政府授予江苏省优秀教师奖，2003年被中华中医药学会聘为终身理事，2006年获中华中医药学会首届中医药传承特别贡献奖，2009年获中华中医药学会全国先进名医工作室奖，2011年获江苏省医师终身荣誉奖。
一、临床实践1952年在上海松江首次开设中医耳鼻咽喉科，北京进修后成为第一位掌握现代耳鼻喉科知识的中医师。1972年成立全国第一家中医耳鼻咽喉科，创“鼻渊合剂”、“参梅含片”、“还听丸”等新药；主持成立“嗓音病”、“过敏性鼻炎”等专病门诊。从医八十年，誉满海内外。
二、创新学术建立了“干氏中医耳鼻喉科理论体系”，并为全国同行认同。
（一）五诊学说：认为除望闻问切四诊外，增加耳鼻喉科“查诊”，成为具有特色的“五诊”，有利于辨病和辨证。如在喉科打破了“金实不鸣、金破不鸣”的传统理论。
（二）耳鼻喉科脾胃学说：用补中益气汤治疗慢性咽炎，打破了“白术不入喉科”古训。还善用健脾益气法治疗鼻炎、中耳炎等。
（三）嗓音学说：提出“喉有五属：无形之气者，心为音声之主，肺为音声之门，脾为音声之本，肾为音声之根。有形之质者，声带属肝，得肺气之鼓舞而能震颤；室带属脾，得气血之濡养而能活跃；会厌、披裂属于阳明，环杓关节隶乎肝肾。”对嗓音医学很有指导意义。
（四）“中介证”学说：把外感六淫侵犯人体而直接致病者列为一级中介证；把内伤七情致病的证候、六淫致病后转化而生的证候(如风化燥、寒化热)以及继发致病因素(痰饮、瘀血)等致病者列为二级中介证；把病情重笃的证候列为三级中介证。
（五）温阳法治疗过敏性鼻炎：他根据患者鼻涕清稀、遇寒加重等特点，提出温阳补肾法治疗过敏性鼻炎，后来成为全国同行最常用的方法。
（六）耳聋治肺、鼻塞治心：耳病治肾、鼻病治肺为常法，他发现有些耳聋，伴有鼻塞、流涕等症，用三拗汤有效，符合“耳聋治肺”；用入心经的活血化瘀药治疗慢性肥厚性鼻炎，则称为“鼻塞治心”。
（七）泻离填坎、伐震润兑：心、肾、肝、肺，分别与“八卦”的离、坎、震、兑相对应。善用清心火、补肾水、平肝阳、润肺燥，即泻离、填坎、伐震、润兑四法。
（八）粘膜病证“十辨”：归纳了辨色泽、辨疼痛、辨肿胀、辨肿块、辨斑点、辨溃烂、辨假膜、辨痒、辨脓血、辨气味的专科特色辨证。
（九）制定两个被全国规范化教材选用的新病种：多涕症和喉源性咳嗽。
三、科研成果主持、指导完成国家自然科学基金课题1项、科技部课题2项、部省级课题6项，获部省级科技进步奖2项。1980年起主办6期全国中医耳鼻喉科进修班，为全国各地及海外培养大批专科人才。1956年出版《中医耳鼻喉科学》，主编多部中医耳鼻喉科教材。1992年出版代表作《干氏中医耳鼻咽喉科学》，20世纪80年代以来，发表论文、医话等400余篇。
四、藏书状元干祖望一生的最大爱好是藏书和读书。家藏万余册书籍被分成工具书、丛书、医史、医经、本草、方剂、耳鼻咽喉口腔科、各家医籍、医案、西医等10个大类，一以其藏书之多取胜，二以其理书有序而出众。1990年被南京文化界评为“藏书状元”。他将自己的书房命名为“茧斋”，并且自题诗曰：“我事涂鸦你吐丝，两般姿态一般痴；年年自缚琅缳里，乐仅庐陵太守知。”足见他对书的感情之深。