慢性化脓性骨髓炎的治疗，在现代医疗常规认为手术是最重要的治疗手段，这是复杂的病理变化所决定的。尽管手术是治疗本病最重要的手段，但也从中得知，手术并没有都根治于本病，也没有抑制和阻止本病的继续发展。
原因是术后还继续存在以下问题
1、骨与软组织还不具备生理条件，死骨会继续在此基础上产生。
2、在手术还没顾及到感染的骨小空腔内，又没有修复的内环境而骨组织破坏也会继续发展扩大。
3、因炎症的存在，会继续刺激骨组织出现生骨作用，使骨小梁密集增生再次形成硬化的骨组织。
4、骨缺损的存在，因死骨被手术清除，或自行脱落的较大死骨形成了炎性空洞，本空洞可能会引起续脓作用，而继续累害着骨与软组织。
5、软组织因炎症的刺激和手术的影响，形成了疤痕组织过多，血运更差，抗感染能力下降。
6、因手术和疾病的变化，有些部位常缺乏皮肤和肌肉覆盖。开放的感染创面会造成细菌继续感染的机会与条件。